Yo he tenido las 2.
La "gorda" se calienta mas, consume mas, ocupa mas sitio, tiene 4 USB 2.0.
La "flaca" consume menos energía, tiene un procesador mas rápido, tiene 2 USB 2.0, es mas manejable pero no es compatible con los juegos de PS2.
Creo que la retrocompatibilidad es un mal que afecta a todas las PS3. La que yo tenía era la primera que salió (60 GB) y esa si era compatible.
Si la quieres para jugar, cualquiera de las dos es válida.
Un saludo.